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2009年10月，中心联合中国农科院、中国农业大学、中国种子集团公司等单位，牵头组建了玉米产业技术创新战略联盟。联盟由22家单位组成，其中包括8家企业、8家科研院所与6所大学，符合当前产学研结合的发展趋势。
2010年1月22日，科技部下发审核意见，认为联盟的组建符合加速推进农业现代化、建设社会主义和谐新农村的国家战略目标要求，申请材料对产业现状、技术现状等准备充分，联盟技术创新活动与国家的战略目标以及相关产业发展政策等密切关联。联盟成员具有明显的行业代表性，对推动产业发展和技术创新活动能够起到积极地推动作用，联盟组建的必要性和技术性审核通过。
2012年4月， "玉米产业技术创新战略联盟"被科技部确定为"2012年度产业技术创新战略联盟试点名单"。
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